به منظور تربیت همه جانبه دانشگاهیان پیشگام و فعال در تراز انقلاب اسلامی که برای انجام رسالت الهی خود هم زمان با تحصیل دروس دانشگاهی به تهذیب نفس ،فراگیری علوم اسلامی و کسب مهارت جهاد علمی فرهنگی و خدمت خالصانه به دین می پردازند ،در دستور کار حوزه قرار گرفت تا با ترسیم الگویی از ارزش ها و اهداف دانشگاه اسلامی ،گامی در جهت اسلامی شدن هر چه بیشتر دانشگاه برداشته و مصداقی از این آیه شریفه باشد :" و کذلک جعلناکم امه وسطا لیکونوا شهداء علی الناس و یکون الرسول علیکم شهیدا"

با توجه به سند دانشگاه اسلامی ،حوزه علوم اسلامی دانشگاهیان مجموعه ای تربیتی آموزشی با رویکرد جهاد علمی فرهنگی و اثرگذاری اجتماعی است که با بهره گیری از میراث اخلاقی و معرفتی حوزه های علمیه به تبیین اسلام ناب و تربیت دانشگاهیان توانمند و موثر در مسیر تحقق آرمان های انقلاب اسلامی و ایجاد ارتباط دوسویه حوزه علمیه و دانشگاه مبادرت می نماید.

ماموریت حوزه ایجاد مجموعه ای منسجم،اثرگذار ،جریان ساز در راستای فرایند تحقق اهداف انقلاب اسلامی و تربیت دانشگاهیان (اساتید و دانشجویان)تراز انقلاب اسلامی است .

به همت و پیگیری دفتر  نهاد نمایندگی مقام معظم رهبری در دانشگاه با اخذ مجوز،حوزه علوم اسلامی دانشگاهیان در دانشگاه تشکیل شد.

و در اولین دوره 30 نفرمعرفت جو پذیرش کردکه داوطلبان این دوره ازبین دانشگاه علوم پزشکی و دانشگاه فرهنگیان کاشان می باشند مراحل ثبت نام اوایل بهمن ماه ثبت نام انجام گردید و در 20اسفندماه افتتاحیه و جلسه توجیهی در سالن طبیب بصورت حضوری و مجازی ( اسکای روم )باحضورمسئول محترم نهادحجت الاسلام ابن علی و مدیر محترم گروه معارف حجت الاسلام شاه فضل و مدیرحوزه علوم اسلامی حجت الاسلام غلامی و اساتید این دوره انجام گرفت.